IE требуют, кстати, ряд веб-приложений, которые работают с ЭЦП. Например, казначейские и госзакупочные.
Там интерфейс браузерный, а ЭЦП обеспечивается с помощью КриптоПро CSP.
Ну, тут проблема лишь в том, что плагин которые генерит оную ЭЦП реализовали в виде ActiveX компонента а не в виде стандартного для всех браузеров (кроме возможно IE) плагина. Кстати, на хабре был как-то разбор этого компонента - качество кода там весьма посредственное. По моему, там даже дыры безопасности имеются.
PS. Кстати, о платежах. Сегодня был в банке - надо было по одному счету заплатить. Это ужас какой-то. Во-первых заплатить в банке карточкой (в том числе того же банка) нельзя. Нужно вначале у них на кассе СНЯТЬ деньги наличкой, затем ими же в этой же кассе заплатить. Во-вторых у них там упорно не помещалось название организации. То есть софт не позволяет произвольную длину названия организации. Видимо в БД у них строка фиксированной длины. В-третьих часть информации о платеже у них в процессе распечатки (или обработки, хз) побилась. Банковское ПО - это абсолютно феерический быдлокод похоже. Ну и судя по тому, что мне рассказывают люди которые пишут оное ПО :-)